آیت الله العظمی مدرسی در واکنش به تصمیم آمریکا در مورد معرفی قدس به عنوان پایتخت اسرائیل، امت اسلامی را به قیامی قدرتمند و حساب شده دعوت کرده و فرمودند: «امت اسلامی باید با این تصمیم به خود بیاید».
و نیز افزودند: «ما هرگونه تصمیمی که قدس شریف را پایتختی برای رژیم غاصب معرفی کند محکوم می‌کنیم».
معظم‌له همچنین عنوان کردند: «این کار یک حلقه از زنجیری است که با اشغال کشورهای اسلامی بعد از جنگ جهانی اول آغاز شده و با مرزکشی بین مسلمانان و ایجاد تفرقه ادامه یافت، و در نهایت با قرار دادن رژیم مجعول صهیونیستی در بین کشورهای اسلامی، مسلمانان را تحت فشار قرار داد».
آیت الله العظمی مدرسی ابراز امیدواری کردند که این تصمیم جدید که بر خلاف قوانین بین‌المللی و تصمیمات سازمان ملل است، باعث بیداری امت اسلامی شود و مسلمانان بدانند که اختلافات و درگیری‌ها آنها را ضعیف کرده است. و در این جهان مادی که امروز ما را احاطه کرده، افراد ضعیف جایی ندارند.
و در ادامه افزودند: «باید با قدرت و حکمت برای ترمیم شکاف‌ها و کاستی‌ها بپا خیزیم، همچنان که لازم است به سوی پروردگار سبحان و حکمت‌های قرآن و سیره پیامبر اکرم صلی الله علیه و آله و سلم باز گردیم».
معظم‌له همچنین فرمودند: «شاید این تصمیم ظالمانه وسیله‌ای برای گسترش تندروی باشد و بعید نیست کسانی که این تصمیم را گرفتند، چنین هدفی را دنبال کنند».
آیت الله العظمی مدرسی در پایان تاکید کردند: «همگی ما باید در مقابل تکفیری‌ها و تروریست‌ها هشیار باشیم و با پیش گرفتن مسیر حكمت، نیروی از دست رفته خود را با یک خیزش متمدنانه و عقلانی باز پس گیریم».
