آیت الله العظمی مدرسی در جهت حل مشکلات و کشمکش‌هایی که جوامع اسلامی را درگیر خود کرده است، طلاب علوم دینی را به گستراندن شاخه‌های حوزه‌های علمیه به تمامی خانه‌ها و در میان خانواده‌ها دعوت کردند.
معظم له طی مراسمی که در مسجد جامع موسی الکاظم علیه السلام در شهر مقدس کربلا و به مناسبت میلاد پیامبر اعظم صلی الله علیه و آله برگزار شده بود، حوزه‌های علمیه را مصداق مشکاة در آیه ۳۵ سوره مبارکه نور (اللّه نُورُ السَّماواتِ والأرضِ مَثَلُ نُورِهِ كَمِشْكَاةٍ … ) برشمرده و تاکید کردند: «حل مشکلات جامعه در حال حاضر محقق نخواهد شد مگر با بازگشت به این مشکاة و فانوس هدایت».
همچنین ایشان در بخش دیگری از فرمایشاتشان عنوان کردند: «علمای اسلام در طول تاریخ در میدان‌های مختلف ایستادگی و مقاومت کرده و انواع فداکاری‌ها را با جان و دل تقدیم دین مبین کردند و همواره در معرض تهدید، بازداشت، شکنجه، تبعید و حتی قتل قرار گرفتند اما هرگز عقب‌نشینی نکردن؛ چرا که آن‌ها مدافع ارزش‌های آسمانی و عقیده راستین بودند. بنابراین حوزه‌های علمیه‌ای که در سراسر سرزمین‌های اسلامی از ایران و عراق تا جبل عامل گسترده بودند، جایگاه علمای دلیری شدند که از دین، عقیده و کرامت انسانی پاسداری کردند».
آیت الله العظمی مدرسی طلاب و علما را به نکاتی بدین شرح سفارش نمودند:
۱– «همواره به کتاب‌ها و تالیفاتی که میراث علمای پیشین است و با جهد و تلاش در فقه و اصول و تفسیر و غیره تهیه شده، استناد کنید».
۲– «با قرآن و روایات اهل بیت علیهم السلام انس بگیرید، تا فرهنگ قرآنی و دینی شما تکامل یافته و به فهم علوم مختلف دینی و پیشرفت در تحصیل علم شما کمک کند. در گذشته فکر و ذهن طلبه‌ها از علم قرآن و حدیث مملو و سیراب بود و همچون نسل امروز درگیر اینترنت و ماهواره و غیر آن نبودند».
۳– «آگاهی از امور روزمره و واقعیت‌های جامعه برای طلبه بسیار ضروری است. هنگامی که تعداد علما و خطبا به نسبت جمعیت کم و محدود است، باید در تمامی خانه‌ها و بین خانواده‌ها پایگاه داشته باشیم. هر فرد از خانواده خویش آغاز کند و به آنان در تفقه در دین کمک کند و مردم را از مضرات دوری از احکام دینی (همچون تاثیر مال حرام در نسل آینده) آگاه سازد».
